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離子色譜儀基線也就是背景噪音，是在無樣品組分通過色譜檢測器時，檢測器響應信號的隨機分布?；€的異常往往代表離子色譜儀的各個部位出現(xiàn)問題，會影響檢測結果的準確性。操作人員需要掌握基線常見異常的原因以及處理方式。
1.基線噪聲大
離子色譜儀如果長期不用后，再開機通常出現(xiàn)基線噪聲大的問題。存在的原因主要包括抑制器離子交換膜缺乏活性、色譜柱或電導池受污染嚴重、系統(tǒng)流露中存在氣泡，電路系統(tǒng)接地不良等原因。處理基線問題，通常需要檢查電路系統(tǒng)，看是否可靠接地；另外需要打開排氣閥門，排出流路中的氣泡，并對色譜柱、電導池等進行清洗。
2.基線漂移大
這類故障主要是因為室內環(huán)境過高，溫度波動性大或者是因為淋洗液濃度沒有達到平衡，系統(tǒng)內部存在滲漏現(xiàn)象或者系統(tǒng)內進入氣泡。另外也需要檢查若基線系統(tǒng)電路是否有故障，對系統(tǒng)恒流源電路部分進行檢查測量。
3.分離度成重現(xiàn)性不穩(wěn)定
這類現(xiàn)象主要在于是樣品中某離子或多種離子濃度太高或者淋洗液濃度過高造成，另外，試劑與去離子水的純度達不到要求，淋洗液流量不穩(wěn)定，測定環(huán)境室溫不穩(wěn)定等因素造成。
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