細(xì)胞株構(gòu)建是生物學(xué)常用的工具之一，也是很多項(xiàng)目的關(guān)鍵步驟，構(gòu)建一個(gè)好的細(xì)胞株也就成功了一半。但目前我們可能更多關(guān)注的是下游的細(xì)胞實(shí)驗(yàn)，例如獲得的構(gòu)建好的質(zhì)粒轉(zhuǎn)染、富集、篩選、優(yōu)化及放大等等。而且已經(jīng)有很成熟的自動(dòng)化設(shè)備來幫助我們進(jìn)行相應(yīng)的液體操作，包括貝克曼也有全套的自動(dòng)化解決方案。但這些前提都是我們獲得了一個(gè)優(yōu)質(zhì)的質(zhì)粒。如果不是呢？
那我們該如何快速又系統(tǒng)的設(shè)計(jì)我們想要的細(xì)胞株呢？如何提高細(xì)胞株效能，降低風(fēng)險(xiǎn)？有如何利用有限的資源更快的做更多的測試？
基因-蛋白-細(xì)胞，系統(tǒng)化設(shè)計(jì)
非常幸運(yùn)的是，分子生物學(xué)和生物信息學(xué)技術(shù)的發(fā)展，給了我們從基因、蛋白、細(xì)胞層面等系統(tǒng)設(shè)計(jì)的可能，各種新的思路和新的技術(shù)，如基因組裝、基因編輯、PCR、NGS測序技術(shù)和TXTL無細(xì)胞表達(dá)系統(tǒng)等技術(shù)可以幫助我們開展測試。
Echo微量化，顯著降低成本，讓新技術(shù)更經(jīng)濟(jì)
系統(tǒng)化的設(shè)計(jì)必然會(huì)帶來更大的樣本量，從而導(dǎo)致更高的費(fèi)用，這也是大家對新技術(shù)和多因素考慮一個(gè)望而卻步的原因。Echo采用聲波的能量進(jìn)行無接觸式移液，且每滴液滴僅為2.5nL或25nL，因此可以直接省去吸頭耗材的消耗，也可以將檢測反應(yīng)體系降低5-100倍，使成本急劇下降。
Echo快速任意孔到任意孔移液，加快組裝，使結(jié)果更一致
在基因組裝中將不同的DNA片段混合，在檢測反應(yīng)中將不同的成本組合，在NGS文庫構(gòu)建過程中將多個(gè)文庫pooling到一起，在CRISPr基因編輯中構(gòu)建sgRNA文庫等等，都需要進(jìn)行快速、變化體積、靈活加樣，這也是傳統(tǒng)移液工作站很難突破的一點(diǎn)，往往也要1小時(shí)甚至幾小時(shí)才能完成。聲波移液技術(shù)Echo的任意孔到任意孔的快速移液特點(diǎn)則讓此類應(yīng)用簡單、快速化，僅需幾分鐘即可，大大優(yōu)化工作流。
Echo加樣精準(zhǔn)，提高克隆效率
使用Echo進(jìn)行微量化DNA組裝，可以在構(gòu)建更低的情況下獲得更高的轉(zhuǎn)化效率。在Gibson組裝中，反應(yīng)體系500nL和1000nL時(shí)轉(zhuǎn)化效率不差于手工操作20uL，反應(yīng)體系降低40倍；在Golden Gate組裝中，表現(xiàn)更佳，反應(yīng)體系低至50nL時(shí)轉(zhuǎn)化效率就不差于手動(dòng)操作7.5uL，反應(yīng)體系可降低150倍。
Echo以微量化、納升精準(zhǔn)化、快速任意孔到任意孔移液，加快細(xì)胞株開發(fā)
欲了解更多應(yīng)用，請?jiān)L問貝克曼
Reference：
Smart DNA Fabrication Using Sound Waves: Applying Acoustic Dispensing Technologies to Synthetic Biology. Kanigowska et al. Journal of Laboratory Automation 1–8, 2015.
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