典型應用領域介紹
廣泛應用于:分子標記輔助育種、基因組學、系統(tǒng)生物學和分子進化、轉基因研究等生物化學研究領域植物組織核酸提取。
分離完整種子中的核酸,需先用機械方法破碎種子,再提取和純化核酸。通常的機械破碎方法速度很慢而且易導致交叉污染,不適合高通量的種子破碎。
用GENO 對微孔板中的種子進行研磨,可從種子細胞中快速釋放出大量核酸;再從勻漿液中分離純化出核酸。例如:用水浸泡過夜大豆,3 分鐘內被均質化成漿液,用于DNA 分析的材料來源。
從培養(yǎng)細胞中快速提取基因組D N A為P C R 分析做準備
PCR 技術提高了核酸檢測和定量測序效率。但在模板擴增前需要一個包括細胞收集和核酸溶解純化的步驟,過程緩慢。然后用層析樹脂把核酸從裂解液中分離出來。需要耗費大量時間和昂貴的材料。
GENO 技術快速破碎大量培養(yǎng)細胞,為后期基因組DNA 進行PCR 分析做準備。GENO 對微孔板中大量培養(yǎng)細胞,進行高通量均質化處理,再通過層析樹脂對核酸進行純化,從而進行PCR 分析,大大提高基因組分析的效率。
Yeast 酵母的9 6 孔高通量破碎
酵母已成為基因表達研究和蛋白質重組表達的通用宿主,成為生物系統(tǒng)研究模式型生物,成為生物藥學家的有力工具。包括Picbia、Hansenula、Debaryomyces 均被研究者所使用,酵母mRNA 和細胞內蛋白,很難用傳統(tǒng)酶解方法提取。裂解酶中通常含有核糖核酸酶和其他蛋白,它們不僅會攻擊細胞壁,而且會攻擊特定分子。并且,酶解產生的原生質體,需借助特定的試劑進行溶解,而導致很多蛋白質變性失活。
通常的壓榨或球磨方式,只能在單樣品下破碎酵母細胞,釋放其內溶物,操作效率太低。GENO 專為那些需要大量酵母克隆進行高通量篩選檢測的實驗,設計了破碎種子的深孔板,在深孔板中對酵母進行破碎。實現高通量地分裂細胞。
細菌細胞的裂解(嗜鹽菌和桿菌)Bacterial Cells
GENO 借助碰撞,裂解細菌細胞。以格蘭氏陰性耐鹽菌Halomonas elongate 和格蘭氏陽性桿菌為模式的研究對象,SPEX 發(fā)展了兩種相應技術:1)細菌培養(yǎng),收獲并沖洗掉多余的培養(yǎng)基,將細胞懸浮于深孔板的鹽水溶液中,2)GENO 可借助研磨介質, 進行細胞振蕩破碎,6-9 分鐘就釋放出足夠量的核酸,進行后續(xù)試驗。
QuEChERS 方法
Geno/Grinder 研磨儀可用于QuEChERS 方法中的樣品處理步驟,可以用Geno研磨儀進行水果、蔬菜植物組織的均質化,從而更高效、快速的研磨處理樣品,為后續(xù)的LC/MS/MS 方法測試殘留農藥做準備??梢栽谑覝叵戮|化或者配合Kryo-Tech 冷凍裝置使用,為了消除交叉污染需要添加QuEChERS 試劑。
目前,美國FDA 食品藥品管理局和美國環(huán)保局EPA均采用Geno 研磨儀作為標準設備進行水果、蔬菜植物組織的均質化處理。
根據美國環(huán)保署U S E P A 和食品藥物管理局U S F D A, L C / M S / MS 測試食品殘留農藥,樣品處理采用不同方法之比較說明
采用GENO/Grinder 萃取器來增快殘留農藥, 霜脲氰(Cymoxanil),的LC/MS/MS 分析之樣品處理,其產能達到一般方法三倍、杜邦方法兩倍數量的樣品,大大節(jié)省時間人力成本的耗費?;厥章?SPIKERECOVERY) 和其他QA/QC 的效果一致。
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