NIST SRM 2374 用于外部RNA控制的DNA序列庫(kù)旨在用作使用體外轉(zhuǎn)錄 (IVT) 進(jìn)行核糖核酸 (RNA) 對(duì)照合成的模板。

NIST SRM 2374 用于外部RNA控制的DNA序列庫(kù)旨在用作使用體外轉(zhuǎn)錄 (IVT) 進(jìn)行核糖核酸 (RNA) 對(duì)照合成的模板。這些 RNA 對(duì)照旨在用作外部對(duì)照或“加標(biāo)”對(duì)照，通過(guò)對(duì)基因表達(dá)測(cè)量的技術(shù)性能進(jìn)行定量評(píng)估來(lái)支持基因表達(dá)測(cè)定的可信度。

一個(gè) SRM 單元包含 96 個(gè)不同的 0.5 mL 聚丙烯管，其中通過(guò)吸光度 (A260) 測(cè)量，每個(gè)脫水質(zhì)粒脫氧核糖核酸 (DNA) 約為 10 µg。每個(gè)試管都含有質(zhì)粒 DNA，其具有*的模板序列，用于不同的外部 RNA 對(duì)照。這些控制是與外部 RNA 控制聯(lián)盟 (ERCC) 合作開(kāi)發(fā)的。

NIST SRM 2374 用于外部RNA控制的DNA序列庫(kù)這些模板可以很容易地用于制作 RNA 控制（參見(jiàn)圖 1）。根據(jù)轉(zhuǎn)錄的鏈，對(duì)照將模擬“有義”或“反義”真核信使 RNA (mRNA)。當(dāng)用于制造有義對(duì)照 RNA 時(shí)，每個(gè)對(duì)照在 3' 端將有一個(gè)標(biāo)稱的 24 個(gè)核苷酸 (nt) 多聚腺苷酸 (polyA) 片段。由它們產(chǎn)生的 DNA 模板和 RNA 轉(zhuǎn)錄本在圖 2 和圖 3 中進(jìn)行了注釋和描述。對(duì)照序列范圍從 273 nt 到 2022 nt，GC 分?jǐn)?shù) (1) 有兩種群體分布，一種以 35% GC 為中心，另一種以 47% 為中心。

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