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NIST RM 8393 DNA全基因組變異評(píng)估標(biāo)準(zhǔn)品

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NIST RM 8393 DNA全基因組變異評(píng)估標(biāo)準(zhǔn)品旨在用于驗(yàn)證、優(yōu)化和過程評(píng)估目的。

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NIST RM 8393 DNA全基因組變異評(píng)估標(biāo)準(zhǔn)品旨在用于驗(yàn)證、優(yōu)化和過程評(píng)估目的。它由來(lái)自個(gè)人基因組計(jì)劃 (ID hu91BD69) 的東亞(中國(guó))血統(tǒng)的男性全人.類基因組樣本組成,可用于評(píng)估基因組測(cè)序中變異調(diào)用的性能。



一個(gè)單位RM 8393 由一個(gè)含有人類基因組 DNA 的小瓶組成,該基因組 DNA 從 Coriell 醫(yī)學(xué)研究所(新澤西州卡姆登)的人類淋巴母細(xì)胞系 GM24631(標(biāo)記為 HG-005)的單個(gè)大型生長(zhǎng)中提取。該小瓶含有大約 10 µg 基因組 DNA,DNA 位于 TE 緩沖液(10 mM TRIS,1 mM EDTA,pH 8.0)中。



NIST RM 8393 DNA全基因組變異評(píng)估標(biāo)準(zhǔn)品旨在通過獲得真陽(yáng)性、假陽(yáng)性和假陰性的估計(jì)值來(lái)評(píng)估人類基因組測(cè)序變異檢出的性能。測(cè)序應(yīng)用可能包括全基因組測(cè)序、全外顯子組測(cè)序和更有針對(duì)性的測(cè)序,例如基因組。這種基因組 DNA 的分析方式與實(shí)驗(yàn)室處理和分析提取的 DNA 的任何其他樣本相同。由于 RM 是提取的 DNA,因此它對(duì)于評(píng)估 DNA 提取等分析前步驟沒有用處,但它確實(shí)挑戰(zhàn)了測(cè)序文庫(kù)的制備、測(cè)序機(jī)器以及作圖、比對(duì)和變異調(diào)用的生物信息學(xué)步驟。此 RM 并非旨在評(píng)估后續(xù)的生物信息學(xué)步驟,例如功能或臨床解釋。




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