Azure Sapphire™NIR-Q使多重Western blotting標(biāo)準(zhǔn)化變得輕而易舉
現(xiàn)代數(shù)字檢測儀器對于western blotting不僅僅是檢測“有或沒有”的技術(shù)，還可以進(jìn)行western blotting重復(fù)性和定量的檢測。在檢測方法的線性動態(tài)范圍，對數(shù)據(jù)進(jìn)行標(biāo)準(zhǔn)化以控制蛋白上樣量和膜轉(zhuǎn)印帶來的變化，可以獲得真正的定量結(jié)果。 但是，對蛋白印跡進(jìn)行標(biāo)準(zhǔn)化的好方法是什么？ 過去，金標(biāo)準(zhǔn)標(biāo)準(zhǔn)化方法是使用看家蛋白，基于這些蛋白在不同實(shí)驗(yàn)條件下和細(xì)胞系中表達(dá)*的假設(shè)。 然而，近的研究表明，這種假設(shè)并不總是正確的，導(dǎo)致相對蛋白豐度的測量結(jié)果不準(zhǔn)確。 相反，定量Western blotting專家和他們發(fā)表的期刊正在*一種新的金標(biāo)準(zhǔn)用于標(biāo)準(zhǔn)化，總蛋白定量 - 通過在膜上染色，檢測每個泳道的總蛋白進(jìn)行標(biāo)準(zhǔn)化分析。
Azure Biosystems™的Sapphire NIR-Q雙模式多光譜激光成像系統(tǒng)具有兩個用于近紅外熒光檢測（700nm和800nm）的通道和用于檢測總蛋白的第三通道，使多重Western blotting標(biāo)準(zhǔn)化變得輕而易舉。
您可以繼續(xù)使用相同的NIR染料，同時加入總蛋白質(zhì)染色劑，例如我們的低背景和易于使用的AzureRed試劑。 無需剝離和重孵育能夠檢測兩種不同的蛋白和總蛋白信號。
> 定量更準(zhǔn)確
> 檢測更靈活
> 平臺設(shè)計(jì)更靈活
> 模塊化設(shè)計(jì)
使用看家蛋白進(jìn)行標(biāo)準(zhǔn)化
使用看家蛋白大缺點(diǎn)是在樣品間和不同條件下表達(dá)水平可能不*。如使用看家蛋白進(jìn)行標(biāo)準(zhǔn)化，必須先花費(fèi)時間和精力來驗(yàn)證蛋白的選擇，并且可能需要檢查多種潛在的標(biāo)準(zhǔn)品，然后才能找到一種在所有樣品中真正表達(dá)同一水平，并且在不同實(shí)驗(yàn)條件下不會發(fā)生變化的標(biāo)準(zhǔn)品。
使用看家蛋白的第二個重大挑戰(zhàn)是它們的表達(dá)豐度很高，如果樣品中的看家蛋白表達(dá)非常高，這會限制在凝膠上加載的樣品量，因?yàn)樾枰Ａ艨醇业鞍自诰€性檢測范圍內(nèi)并且不會使看家蛋白的信號飽和。 如果感興趣的蛋白不是同樣高度表達(dá)，這兩種蛋白質(zhì)不在同一線性檢測范圍內(nèi)。
如果您正在進(jìn)行多重蛋白印跡，例如比較同一蛋白質(zhì)的磷酸化和非磷酸化形式，則需要考慮的第三個挑戰(zhàn)是從不同物種中產(chǎn)生一抗和二抗的復(fù)雜性。
后，檢測的看家蛋白可能干擾感興趣蛋白的檢測。理想情況下，看家蛋白應(yīng)該與感興趣蛋白的大小不同，因此這兩種蛋白可在印跡上空間分辨。 當(dāng)實(shí)驗(yàn)在同一印跡上檢查多種目的蛋白時，這變得越來越困難。
圖1.與常見的看家蛋白相比，AzureRed具有更寬的線性動態(tài)范圍
單色通道圖像A）AzureRed染色總蛋白B）Tubulin C）β-action和D）GAPDH。 AzureRed信號的優(yōu)異動態(tài)范圍與實(shí)際加載的蛋白量顯示在圖像（A）中。使用AzureSpot軟件定量來自總蛋白和看家蛋白的信號，并將得到的值相對于每個樣品加載的蛋白量（E）作圖。與常見的看家蛋白相比，AzureRed表現(xiàn)出更強(qiáng)的相關(guān)性和更廣泛的動態(tài)范圍。
使用總蛋白進(jìn)行標(biāo)準(zhǔn)化
使用總蛋白標(biāo)準(zhǔn)化，不是試圖找到可以代表轉(zhuǎn)移到膜上的樣品總量的蛋白，而是直接在膜上測量總蛋白，并且該值在標(biāo)準(zhǔn)化時用作分母。許多總蛋白染色劑可用于染色凝膠和膜?？偟鞍兹旧峁└鼘挼膭討B(tài)范圍，并且表現(xiàn)出比看家蛋白更低的可變性和更清楚的數(shù)據(jù)。
總蛋白標(biāo)準(zhǔn)化比使用看家蛋白質(zhì)快得多，特別是對于化學(xué)發(fā)光印跡，因?yàn)橄鄬τ趧冸x和重孵育染色步驟花費(fèi)較少的時間。 理想情況下，在免疫檢測之前或之后，在膜上進(jìn)行總蛋白染色。使用一些染色劑如AzureRed Fluorescent Total Protein Stain，可以在免疫檢測前對印跡進(jìn)行染色，然后與目的蛋白同時對總蛋白進(jìn)行成像。 通過這種較簡單的工作流程，目的蛋白和總蛋白的圖像會自動對齊。
與使用看家蛋白相比，圖像捕獲后的分析工作流程基本不變；整個泳道或泳道中大部分信號用于標(biāo)準(zhǔn)化，而不是單一的條帶。
用總蛋白染色劑對膜進(jìn)行染色提供了額外的質(zhì)控優(yōu)勢，可以驗(yàn)證轉(zhuǎn)印是否*。
使用AzureRed進(jìn)行的總蛋白質(zhì)標(biāo)準(zhǔn)化很容易適合任何蛋白質(zhì)印跡工作流程
